实验室设计应保证生物、化学和物理危害在工作区域的风险程度控制在相应的保护水平，防止危害进入周围环境。为了实现这一目标，实验室设计尤为重要。建筑业和生物安全领域的相关国家或行业标准必须严格执行设计和施工图纸。除了自身独特的施工要求和管理规定外，生物安全实验室基本上可以说是负压清洁实验室。关于洁净室的建设也可以参考GB50073-2001《洁净厂房设计规范》、GB50243-2002《通风与空调工程施工及验收规范》、JGJ71-1990《洁净室施工及验收规范》、GB15982-1995《医院消毒卫生标准》、《医院洁净手术部建筑技术规范》GB50333-2002、国家污水综合排放标准GB8978-1996等。设计图纸和竣工图应按规定归档保存。如需报规划部门或者环保部门审批，应当办理审批手续。

　　虽然设计图纸是由设计单位提出并绘制的，但实验室的设计不仅仅是设计单位的问题，更需要实验室人员、基础设施人员和设计人员的密切配合。设计单位的设计人员往往不了解实验室的具体情况，实验室建设者(使用单位基础设施部门和实验室使用者)通常要在这个内容中承担更多的工作。能否形成良好的设计，是设计人员与实验室人员积极有效沟通的关键。实验人员提出的具体建设要求，在一定程度上决定了他们未来的工作环境和工作条件。实验人员应首先拟定一个平面布局草图，并在所需网络、电话、实验设备等方面注明各个区域的名称、功能和特殊要求。要求越细越好。例如，清洁度要求的区域应注明清洁水平和出风口位置;每个房间的用电负荷应该概括;绘图表面仪器设备的位置和具体用电要求，以便设计人员设计实验室内电路;如果设备有高电负荷或特殊用电需求，应标明设备的位置并说明用电情况;标明试验台、水池、电源插座、通风柜、传送窗等设施的具体位置;要求实验室设备的材料和风格。如果是改造项目或新项目的装修阶段，设计师有时需要与实验室工作人员现场检查房屋状况，防止原始图纸与现场状况不一致。此外，需要提到的是，设计公司是否专业，是否有这方面的工作经验也很重要。如果能找到一家经验丰富的专业实验室工程公司，实验室工作人员的设计压力可以大大减轻，高质量的生物安全实验室可以建成。