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传统的空调系统，尤其是空调箱内的空调系统，是细菌的良好滋生地。然而，只要破坏或消除细菌滋生的条件，抑制或减少室内细菌的发生，并切断空调系统所有潜在的污染传播途径，细菌滋生的所有可能性都可以消除。这与传统观念不同：解决微生物污染问题不是灭菌或灭菌方法，而是防止其发生。
因此，无菌空间应被视为一个控制体，包括设施、环境、材料和人员在内的整个过程操作都应受到控制，而不仅仅是操作本身。只有消除整个过程中可能导致微生物污染的所有隐患，才能符合微生物控制的原则，为无菌环境控制提供更有效的保证。全过程控制应包括进入控制体前控制、进入控制体后控制和控制体退出后控制。
进入预控，即在进入控制体之前，所有人和物如人员、仪器和材料都应严格消毒，空气应通过生物清洗技术进行有效过滤和消毒，以确保进入控制体的空气无菌、无尘。由于无菌空间内有许多细菌来源，空间外被污染的空间随时随地都会渗透进来。为了保持空间无菌，后-进入控制的重点应该是空间污染和人与物、人与物之间的交叉污染。
因此，可以采取生物清洁技术的综合措施，如合理的建筑布局，规划人流和物流，消除细菌源的二次污染，减少交叉污染的隐患;设置气闸或缓冲器，控制整个区域的梯度压差，完全防止室外污染进入;依靠室内气流技术，利用大量低速空气以所需的流动模式(湍流或单向流动)稀释(或挤出)室内所有细菌，从而有效维持无菌空间。出口后控制同样重要，如加强清洁、清算和处置的管理。只有及时清除所有污物和废物并妥善处理，才有可能保持无菌空间和保护环境。
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